激闘の末にバルトフェルドを倒したストライクとアークエンジェルは、アラスカに向け進路を取る。なぜか「明けの砂漠」のカガリまで、自分は必要だと主張し、強引にアークエンジェルに乗り込んでくることになってしまった。
紅海に入り、これまで緊張を強いられていたアークエンジェルにも、ひとときの休息が訪れていた。潮風を受け、休息を取るクルーたち。
キラをめぐって、カガリとフレイのさや当ても、デッキで繰り広げられる…。
だが、そんな余裕もつかの間、静寂を破るかのように、ザフトのモラシム隊が空中戦用MSディンと水中用MSグーンを率い、空と海両面からアークエンジェルに攻撃を仕掛ける！　バズーカを装備し、水中に入るストライク。初の水中戦に苦戦をしいられるストライクだったが、何とか2機のグーンを撃退する。
一方、宇宙に残っていたクルーゼ隊のアスランとニコル・アマルフィも、アークエンジェル追撃作戦に合流するために、地球に向けて出発するのだった。